近年来，长三角跨流域管理机制正不断创新。

　　

　　2019年底，沪苏浙联合太湖局树立太湖淀山湖湖长协作机制。本年，沪苏将着力推进元荡、淀山湖等跨界河湖协同管理项目；沪苏浙继续加强太湖、淀山湖蓝藻联合防控与打捞；浙皖将加强新安江河长制协作，优化水质监测、水生生物维护等作业。同样在本年，“一河（湖）一策”修编将启动，要点加强省际边界河湖“一河（湖）一策”联合修编，其间太湖由江苏牵头、淀山湖由上海牵头、新安江由浙江牵头。

　　

　　联合河（湖）长已成常态。长三角生态绿色一体化发展演示区内47条跨界河湖设置了73名联合河（湖）长。7月25日，嘉兴桐乡、湖州南浔、苏州吴江三地在桐乡乌镇举行两省三县联合河长制作业室揭牌典礼，三地“联合河长制”从项目化办理转向实体化运作。此外，湖州也正创新区域联动机制，树立太湖共治机制，签订湖州—嘉兴、湖州—吴江环境友好区域协作意见，树立联动治水机制。

　　

　　在演示区内，青浦、吴江、嘉善三地正探究演示区一体化供水市场化改革运作机制，以及加快树立太浦河生态维护补偿机制。6月30日，演示区先行启动区要点项目开工典礼举行，水乡客厅蓝环工程（青浦、吴江段）等10个要点项目开工，其间生态绿色项目8个。此次开工的蓝环工程（青浦、吴江段），聚焦“水安全、水生态、水环境、水景观”，会集展示水乡客厅水生态管理新成效、一体化制度创新新效果。